Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf354cQ571J5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms