Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Opa3Q505D7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Opa3Q505D7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opa3Q505D7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opa3Q505D7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opa3Q505D7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opa3Q505D7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opa3Q505D7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Opa3Q505D7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opa3Q505D7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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