Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otol1Q4ZJM7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms