Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms