Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms