Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms