Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Krtap9-3Q3V2C1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms