Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2Q3V1H1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms