Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms