Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b4Q3V0X2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b4Q3V0X2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b4Q3V0X2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms