Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zmat1Q3V0C1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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