Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms