Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms