Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chpf2Q3UU43 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms