Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms