Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UPC7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UPC7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms