Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms