Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tmem253Q3UNB8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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