Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp30Q3UN04 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp30Q3UN04 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp30Q3UN04 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp30Q3UN04 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Usp30Q3UN04 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Usp30Q3UN04 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp30Q3UN04 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp30Q3UN04 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp30Q3UN04 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp30Q3UN04 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp30Q3UN04 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp30Q3UN04 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp30Q3UN04 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp30Q3UN04 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp30Q3UN04 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp30Q3UN04 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms