Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd27Q3UMR0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms