Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms