Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn7l3bQ3UD01 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms