Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms