Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms