Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q3U595 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U595 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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