Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VwceQ3U515 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VwceQ3U515 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VwceQ3U515 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VwceQ3U515 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VwceQ3U515 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VwceQ3U515 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VwceQ3U515 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VwceQ3U515 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VwceQ3U515 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms