Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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