Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U1D9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Q3U1D9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Q3U1D9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U1D9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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