Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms