Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms