Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms