Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms