Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdpd4Q3TT99 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms