Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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