Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ctdnep1Q3TP92 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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