Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms