Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrx1Q3TL44 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrx1Q3TL44 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms