Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fubp3Q3TIX6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms