Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms