Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Stt3bQ3TDQ1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Stt3bQ3TDQ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Stt3bQ3TDQ1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stt3bQ3TDQ1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms