Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms