Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp1aQ2LKU9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms