Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam178bQ24JP3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms