Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmntd2Q0VET5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms