Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms