Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms