Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
StumQ0VBF8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms