Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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