Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms