Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms